Gastroenterolojik cerrahi, ülkemizde Genel Cerrahi uzmanlarının sindirim sistemi hastalıkları ve özellikle sindirim sistemi kanserleri ve endoskopik işlemler üzerine 2 yıl boyunca eğitim alıp özelleştikleri bir yandaldır. Gastroenteroloji cerrahları, ağızdan makata, yemek borusunun kanserleri, pankreas, mide ve barsak kanserlerini, safra kesesi, safra yolu ve karaciğer, dalağın cerrahi hastalıklarını tedavi ederler. Ayrıca sindirim sistemi ve kadın hastalıkları kanserlerinin karın zarını tutan evrelerini de karın içi sıcak kemoterapi(hipec) ile tedavisini düzenlemektedirler. İleri endoskopik girişimleri de ayrıca gerçekleştirirler.